Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT23Q9C075 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms