Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM34Q9BYJ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM34Q9BYJ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms