Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPCDR1Q9BY65 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms