Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms