Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms