Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms