Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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