Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM79Q9BSE2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms