Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms