Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms