Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRBNQ96SW2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms