Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms