Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms