Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDCD1Q96RS6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms