Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms