Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAP3Q96P50 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms