Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms