Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms