Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms