Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms