Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLUAP1Q96AJ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms