Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF1Q92879 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms