Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNRQ92752 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNRQ92752 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNRQ92752 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNRQ92752 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNRQ92752 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRQ92752 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNRQ92752 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNRQ92752 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms