Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms