Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms