Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALLDQ8WX93 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALLDQ8WX93 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms