Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms