Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms