Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH13Q8NBN7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH13Q8NBN7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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