Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM87AQ8NBN3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms