Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms