Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms