Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms