Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms