Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTU1Q7Z7A3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms