Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms