Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP6Q6ZN66 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms