Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300LDQ6UXZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms