Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms