Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms