Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms