Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL35Q6PF15 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL35Q6PF15 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms