Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms