Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms