Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms