Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms