Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLX4IPQ5VYV7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLX4IPQ5VYV7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms