Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RSBN1Q5VWQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms