Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOCADQ5VW36 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms