Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT6Q5T7P8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms